Microbiome des ensilages de grains de maïs et de sorgho réhydratés traités avec des inoculants microbiens à différentes périodes de fermentation

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Jan 05, 2024

Microbiome des ensilages de grains de maïs et de sorgho réhydratés traités avec des inoculants microbiens à différentes périodes de fermentation

Scientific Reports volume 12, Numéro d'article : 16864 (2022) Citer cet article 1331 Accès 5 Citations 6 Détails des métriques Altmetric En raison des relations complexes co-évoluées et de l'influence mutuelle

Rapports scientifiques volume 12, Numéro d'article : 16864 (2022) Citer cet article

1331 Accès

5 citations

6 Altmétrique

Détails des métriques

En raison des relations complexes co-évoluées et de l'influence mutuelle entre les changements dans le microbiome et la qualité de la fermentation de l'ensilage, nous avons exploré les effets des inoculants Lactobacillus plantarum et Propionibacterium acidipropionici (Inoc1) ou Lactobacillus buchneri (Inoc2) sur la diversité et la succession des communautés bactériennes et fongiques. de grains de maïs (CG) et de sorgho (SG) réhydratés et de leurs ensilages par séquençage Illumina Miseq après 0, 3, 7, 21, 90 et 360 jours de fermentation. Les effets des inoculants sur la succession bactérienne et fongique différaient selon les grains. Les espèces Lactobacillus et Weissella étaient les principales bactéries impliquées dans la fermentation des ensilages de maïs et de sorgho réhydratés. Aspergillus spp. la moisissure était prédominante dans la fermentation CG réhydratée, tandis que la levure Wickerhamomyces anomalus était le champignon majeur dans les ensilages SG réhydratés. L'Inoc1 était plus efficace que CTRL et Inoc2 pour favoriser la forte croissance de Lactobacillus spp. et maintenir la stabilité de la communauté bactérienne pendant de longues périodes de stockage dans les deux ensilages de grains. Cependant, les communautés bactériennes et fongiques des ensilages de maïs et de sorgho réhydratés ne sont pas restées stables après 360 jours de stockage.

Les grains de maïs et de sorgho ont été utilisés dans des concentrés proposés aux ruminants pour fournir de l'énergie principalement à partir de leur teneur en amidon1. L'endosperme du grain contient la plus grande quantité d'amidon et détermine la valeur économique et nutritionnelle du grain, car la structure et la composition de l'amidon et son interaction physique avec les protéines du grain peuvent altérer sa digestibilité2. L’effet de l’endosperme sur la digestibilité peut être manipulé par la transformation des grains3. L'ensilage de céréales réhydratées est une technique prometteuse pour améliorer la valeur nutritive des céréales4, et parmi les céréales, le sorgho présente le gain de digestibilité le plus élevé après ce processus, suivi par le maïs-grain et d'autres céréales5.

Au cours du processus d'ensilage, l'augmentation de la digestibilité de l'amidon des grains peut être due à la dégradation partielle de la matrice hydrophobe amidon-protéine qui entoure les granules d'amidon par protéolyse6, ce qui entraîne une plus grande solubilisation des prolamines et une augmentation de la surface des granules d'amidon susceptible d'être attaquée par les bactéries du rumen7.

Des études ont montré que les conditions climatiques affectent toutes les étapes de production et d’utilisation de l’ensilage, notamment dans les zones chaudes et humides, car la prolifération microbienne est fortement influencée par la température8. Ces facteurs climatiques affectent non seulement la croissance des cultures fourragères et l’incidence des maladies, mais influencent également la fermentation et la stabilité aérobie de l’ensilage9.

Lactobacillus plantarum serait l’inoculant d’ensilage le plus couramment utilisé10. Cette espèce produit de l'acide lactique, qui réduit rapidement le pH et améliore la fermentation11. Cependant, de grandes quantités d'ensilage ont été perdues et le coût de production pourrait subir des conséquences négatives en raison de la détérioration aérobie ; par conséquent, les bactéries propioniques et les bactéries hétérofermentaires produisant de l'acétate ont été étudiées pour réduire la détérioration des ensilages après exposition à l'air4,12.

L'inoculation bactérienne peut influencer différemment les caractéristiques de fermentation et la valeur nutritionnelle de l'ensilage en fonction des bactéries épiphytes présentes dans la matière première13 et des souches présentes dans les différents matériaux d'ensilage14. Selon Si et al.13, l'ensilage et son microbiote ont co-évolué des relations complexes, et une influence mutuelle existe entre les changements dans le microbiome et les paramètres de fermentation de l'ensilage, comme la corrélation positive entre Lactobacillus plantarum et la teneur en acide lactique. De manière générale, la composition des micro-organismes avant et après l’ensilage subit des changements importants15. La surveillance de ces changements pendant l'ensilage serait utile pour bien comprendre et améliorer le processus d'ensilage16.

 3.0 × 1010 CFU g−1, Propionibacterium acidipropionici > 3.0 × 1010 CFU g−1, and sucrose (Lalsil Milho, Lallemand Animal Nutrition); Inoc2—Lactobacillus buchneri CNCM-I 4323 1.0 × 1011 CFU g−1 and sucrose (Lalsil AS, Lallemand Animal Nutrition) at an application rate of 105 CFU g−1./p>

 80%) of Proteobacteria was observed in both grains at the beginning of the fermentation (day 0), except in CG-CTRL and CG-Inoc1, which had 51% of Proteobacteria and 61% of Actinobacteria, respectively. In all CG silages, Firmicutes phylum dominated (> 84%) the fermentation from 3 to 90 days after ensiling. There was a tendency in the bacterial community to return to its initial diversity at 360 days of fermentation, with the replacement of Firmicutes by Proteobacteria and Actinobacteria./p> 80%) of Lactobacillus from 3 to 90 days of fermentation./p> 85%) of Lactobacillus, as observed in CG-Inoc1 during the initial stages of fermentation, occurred only in SG-Inoc1 silages from 90 days onwards. SG-Inoc2 had similar bacterial succession as SG-CTRL from 90 days onwards, with the presence of different genera in the bacterial community. As observed in CG at 360 days, there were changes in the bacterial taxonomic composition, mainly the replacement of Lactobacillus by Weissella in SG-CTRL silages and Weissella and Kosakonia in SG-Inoc2. However, the changes in SG were mainly at the family level, whereas in the CG silages, substitutions were also observed at the phylum level. The SG-Inoc1 sample presented the greatest stability of the bacterial composition at 360 days, with 93% represented by Lactobacillus./p> 80%) was extended up to 360 days. Dothideomycetes accounted for 56–92% of the initial population in SG samples. Tremellomycetes were also present in significant amounts prior to fermentation in the SG-Inoc1 silage. The initial populations were replaced by Saccharomycetes, with dominance extending up to 90 days in all silages. At 360 days, influential amounts of Eurotiomycetes replaced the Saccharomycetes microorganisms in the SG-CTRL and SG-Inoc1 silages./p> 4.2–4.5)47, which was observed in our study, mainly in SG silages. The absence of this genus in all samples was unexpected, particularly in the recently inoculated samples (day 0)./p>